Juan José Larrea Euskal Herriko Unibertsitateko Erdi Aroaren Historia katedraduna da. Doktoregoa Toulouse II–Le Mirail unibertsitatean eskuratu zuen.

Haren lanak bi ikerketa esparru jorratzen ditu: Baskoniaren eta Iruñeko erreinuaren historia sozial eta politikoa, inperioaren amaieratik lehen aro feudalera arte; eta Goi Erdi Aroko Mendebaldeko landa eremuaren historia, bereziki artxibo karolingio goiztiarrenen bitartez.

Ikerketa esparru biekin lotutako zenbait doktorego-tesiren zuzendaria izan da, eta bada, eta IN moduan Plan Nazionaleko zenbait proiektu koordinatu ditu.

CNRS-Université de Toulouse-Jean Jaurès-eko Framespa laborategiko kide elkartua da, bai eta Cercle de Travail sur les conditions de production du savoir médiévistique (LaMOP-CNRS) delako taldeko kidea ere. Ikertzaile bisitaria izan da Münsterreko Unibertsitateko Institut für Frühmittelalterforschung ikergunean.

2001 eta 2004 artean Euskal Herriko Unibertsitateko euskara errektoreordea izan zen.